截止11月1日，药学院2004级582名学生中有412人与43位校内外导师确定了指导关系，录取率达70.8％，这是该院实行科研导师制四年来录取比率最高的一次。其中32名学生与浙江省药检所、浙江省中药研究所、浙江省医学科学院、杭州市药检所、浙江大学第二附属医院、杭州民生药业集团有限公司和杭州康恩贝制药股份有限公司等单位的10位校外导师确定了指导关系。

作为该院“四位一体”育人体系中的“专业素质拓展平台”，本科生科研导师制一直以来深受学校领导和社会各界朋友的关心与支持。通过该院学生品牌活动——“百草课堂”科研系列讲座、就业系列讲座和学长论坛，广大学生在第二课堂上充分认识到缺乏创新精神、科研思维、实际动手能力的大学毕业生，一旦走向社会将缺乏竞争力，而科研导师制这一平台恰好可以为学生提供锻炼机会。2004级学生科研导师报名工作从今年6月份开始，申报人数占04级学生总人数的90％。为了便于导师们对学生进一步了解，筛选出优秀的学生，学院要求大部分申报的学生在暑假期间跟随导师做实验、做课题，截止10月18日共有326位同学被录用。随后，又有143名学生进行了补报。截止11月1日，共有412名学生与导师确定了指导关系。
    2006年是药学院推行本科生科研导师制的第四个年头，四年来，本着育人、创新的理念，学院在这项特色工作上做了许多探索与尝试，并取得了一定的成效。2005年研究生入学考试中，学院共考取研究生47人，2006年考研学生上线53人，比上年增长12.8% ，其中24人被国内各重点高校录取。